名探偵コナン 絶海の探偵
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早朝、京都府の舞鶴湾で巡回中の海上保安官によって自爆用の爆弾を積んだ1隻の不審船が発見された。
同日、舞鶴港で海上自衛隊によるイージス護衛艦「ほたか」[注 4]の体験航海が開催され、その参加者の中には高倍率の抽選を当てたコナン一行もいた。しかし、その入艦の際の検査は厳しく携帯電話も取り上げられてしまう。航海長の案内の下、順調に航海スケジュールをこなしていく。ところがCICでの公開訓練終了直前に未確認物体が艦体に接近し、艦内は物々しい空気に包まれる。航海長の機転により訓練の一環とされ接近物も危険なものではなかったため、大きな混乱はなかったが、コナンは疑問を抱くようになる。
その後、自由行動中にコナンは航海訓練中に1人だった少年に声をかける。その少年・勇気と彼の父親と別れた直後、イージス艦には乗船していないはずの女性自衛官と遭遇する。調査を開始しようとするコナンとそうとは知らず付き添う蘭は、自衛官の左腕のみが発見された場面に遭遇する。蘭は小五郎の名前を出して捜査協力を申し出て、コナンも平次に連絡し捜査の協力を頼む。
目暮警部たちも海上保安官らとヘリでイージス艦に合流して捜査を開始するが、海自側は何かを隠している様子だった。その後、遺体の胴体部が若狭湾の造船所で、マイクロSDの抜かれた被害者の携帯電話が艦内で発見される。艦長室で不審な行動をする例の女性自衛官・藤井七海を見つけたコナンは機転をきかせ、目暮たちを艦長室に呼び出すことに成功する。そこである国のスパイ・「X」が艦内にいることが告げられる。
コナンたちは藤井七海たち自衛隊からの話を聞いていくうちに、これが日本の運命をかけた大事件であることを知るのであった。
江戸川コナン - 高山みなみ
毛利蘭 - 山崎和佳奈
毛利小五郎 - 小山力也
工藤新一 - 山口勝平
服部平次 - 堀川りょう
遠山和葉 - 宮村優子
鈴木園子 - 松井菜桜子
阿笠博士 - 緒方賢一
灰原哀 - 林原めぐみ
吉田歩美 - 岩居由希子
円谷光彦 - 大谷育江
小嶋元太 - 高木渉
目暮十三 - 茶風林
佐藤美和子 - 湯屋敦子
高木刑事 - 高木渉
服部平蔵 - 小山武宏
遠山銀司郎 - 小川真司
大滝悟郎 - 若本規夫
綾小路文麿 - 置鮎龍太郎
